.fetchmailrc には，自社・常駐先・自宅(テスト用)
それぞれのエントリを skip で記述しておき，
次のようなラッパーを書いて(デーモンとしてではなく) cron から起動するようにしてみた．
なお，自社・常駐先・自宅でネットワークの設定を切り替えるために
IP コンフィグ というツールを使ってホスト名を切り替えるようにしている．

#!/bin/sh
HOSTNAME=`hostname`
case $HOSTNAME in
自社のホスト名)
fetchmail -d0 -s 自社のメールサーバ名
;;
常駐先でのホスト名)
fetchmail -d0 -s 常駐先のメールサーバ名
;;
自宅でのホスト名)
fetchmail -d0 -s 自宅のメールサーバ名
;;
esac

なお，.netrc というファイルにサーバ名・ユーザ・パスワードを書いておくと
fetchmail 起動時にパスワードを聞かれなくなる．
このファイルはもともと ftp コマンド用のものらしい．